GenSCAN (Genomics Single Cell Analysis) permet l’exploration l’hétérogénéité au sein de population de cellules, de tissus ou d’organes par des approches de génomique à l’échelle de la cellule unique.
GenSCAN est équipé du single-cell Chromium controller de 10X genomics (financé par le prix Coup d’Elan de la fondation Bettencourt). L’appareil permet le partitionnement de cellules individuelles pour l’analyse du transcriptome (single-cell RNA-seq), de l’accessibilité de la chromatine (single-cell ATAC-seq) ainsi que l’analyse combinée (Multiome : single-cell RNA-seq + single-cell ATAC-seq).
RESPONSABLES
Responsable technique: Anne-Laure Finoux (équipe Legube, MCD bureau 3042)
Responsable scientifique: Thomas Clouaire (équipe Legube, MCD bureau 3042)